首都医科大学附属北京中医医院药物临床试验机构有药物临床试验专业24个。其中经国家食品药品监督管理总局机构资格认定的临床试验专业有18个（证书编号0187和970），分别是：中医心血管、中医呼吸、中医消化、中医肾病、中医肿瘤、中医皮肤、中医神经内科、中医外科、中医妇科、中医肛肠、中医骨科、中医儿科、中医耳鼻咽喉、中医老年病、中医眼科、感染、中医重症医学、中医风湿病。2020年新增备案专业2个，分别是：中医内分泌、中医泌尿（含男科）。2023年新增备案专业4个，分别是：精神专业、肝病专业、乳腺专业、疮疡血管外科专业。临床试验用药品采用中心化管理，2015年获得中关村玖泰药物临床试验技术创新联盟“临床研究药物中心化管理示范项目”。