1999年我院中医皮肤病学科被北京市中医管理局批准为北京市中医药重点学科，开启了我院重点学科建设项目的历程。 2001年肿瘤科、针灸科被确定为北京市中医药重点学科。2004年中医外科、2005年中医心血管内科先后被北京市中医管理局确定为北京市中医药重点学科。截止目前，我院共有5个北京市中医药重点学科。