肛肠科的科研意识应追溯到1957年，痔瘘科的诸位老中医们当年为了解决枯痔法中所使用药物的毒性问题，外出学习后，采用现代医学科研方法，亲自动手做动物实验（是今天任何一个科室所不能比的），筛选有效而无毒的药物，制成枯痔油（即明矾甘油注射液），首创中药枯痔注射液。是现在通用的消痔灵注射液的前身。

    为解决肛肠科手术后伤口疼痛问题，杜文、王嘉麟医师研制中西药混合制剂“长效麻醉剂Ⅱ号”，并获北京市卫生局科技成果二等奖。（有证书留存）
    1999年许山鹰承担《局部注射法治疗直肠前突的临床观察与实验研究》项目。
    2003年荣文舟承担《扩肛法治疗肛裂规范研究》项目。
    2003年起五位王嘉麟学术继承人荣文舟、杨志生、温小一、陈誩、许山鹰共同编写《王嘉麟医案医话》一书并出版，2005年该书获得国家科学著作奖。
    全科发表《痔与肛垫概念不宜混淆》等专业论文100余篇，并编著出版了、《现代中医肛肠病学》等专著7部。（具体目录见全院总目录）