刘琨师古不泥，博采众长，融会贯通，紧跟时代发展，因人、因地、因时、因病治异，在充分扎根于中医理论的基础上，巧妙结合现代医学研究进展，较早采用中西医联合诊疗方式，提出了很多后来广泛应用于中医妇科临床的学术观点和理念，如中药周期性治疗调整月经的“调周”理论，温肾活血的“促排卵”观点，中医辨证论治处方和现代药理研究相结合选择药物的方法等等。在她的学术思想中反复强调女性培护阴血、疏畅肝气的重要性，关注先天肾气亏盈、后天脾胃的健运。其拟定处方并研究开发的坤宝丸、调经促孕丸，经同仁堂集团生产，多年来畅销海内外，成为治疗围绝经期综合征、功能性不孕症的经典用药。

上世纪七八十年代，为了研究开发坤宝Ⅰ、Ⅱ号方，刘琨主任连续几年深入各大棉纺织厂，利用业余时间，走访了大量不同年龄段的女工，切身了解她们的需求和疾苦。经过反复的思考、摸索和临床研究，刘琨主任认为女性一生经历了经、带、胎、产、乳多个生理阶段，屡伤阴血，诚如朱丹溪所云“阴常不足，阳常有余”，而“女子四十，阴气自半”（《黄帝内经》），所以在绝经期前后就会因阴虚阳亢而出现阴阳平衡的紊乱，导致潮热、出汗、心慌、憋气等一系列的更年期症状。刘琨主任创立坤宝丸正是基于这一中医理论的指导，从育阴潜阳入手，调和阴阳，达到阴平阳秘的状态，很好地帮助绝经期的女性顺利渡过这一特殊时期。在广泛应用于临床后，又不断总结和修改，最后推出了现在的坤宝丸和调经促孕丸，为广大患者带来了福音。

刘琨主任一生挚爱医学事业，长年奋战在临床一线，把毕生的精力都投注到中西医结合治疗妇科疾病的工作中。在她发明的药物名誉海内外的时候，她却依旧过着平淡、普通的生活，默默无闻地奉献着。尽管晚年罹患癌症，仍然抱病坚持门诊，从不推诿病人。她用最大的热情和赤诚的关爱，带给患者战胜疾病、恢复健康的信念和希望。经她诊治的病人，数十年后提起她，依然由衷地表示感谢。